Im Touareg herrscht ein angenehmes Klima dank der "Climatronic" mit 2-Zonen- bzw. optional mit 4-Zonen-Temperaturregelung. Fahrer und Beifahrer sowie optional auch die Fondpassagiere regeln unabhängig voneinander die Einstellungen für ihre Klimazone. Die Heuschnupfen-Allergiker im Auto dürfte es zudem freuen, dass ein Allergenfilter die einströmende Frischluft frei von Pollen hält.

Die Klimaanlage beugt Geruchsbelästigungen vor, indem sie automatisch auf Umluft umschaltet, wenn der Fahrer die Scheibenreinigung betätigt oder den Rückwärtsgang einlegt. Und mit der geschwindigkeitsabhängigen Regelung der Gebläsedrehzahl wird es auch bei langsamer Fahrt nicht zu laut.